La fianza no sirve para compensar ninguna mensualidad, y menos dos.

El casero puede demandar a los inquilinos por el impago de esas dos mensualidades.

Lo normal es que las cobre y condenen a los inquilinos a pagar las costas judiciales.

Lo mejor es intentar llegar a un acuerdo y se me ocurre este:

1.- Muestra el piso a la casera para que vea que está en buenas codiciones y que tendrá que devolverte la fianza.

2.- Pagala el penúltimo mes

3.- Acuerda con ella que el último mes no se lo pagas (a cuenta de una fianza) y el último día, cuando vuelva a revisar el piso y vuelva a ver que todo está en orden, te devuelve la otra fianza (si es que ya la ha recibido ella del organismo donde la ingresara en su día)

Creo que este podría ser un acuerdo aceptable para todas las partes, y así tu no te arriesgas a que te demande por impago de dos meses de renta.

No, legalmente no puedes hacerlo. Legalmente la fianza se deja para que el casero se pueda cobrar posibles arreglos o pagos pendientes cuando se deje el piso, si todo está bien, está obligado a devolvértela en el plazo de un mes, si pasa más de ese mes puedes exigirle intereses por la demora en el pago.